ทะเลสาบล้อมรอบด้วยภูเขาอย่างสมบูรณ์ เทือกเขาไบคาลทางชายฝั่งทางเหนือและไทกา ได้รับการคุ้มครองทางเทคนิคในฐานะอุทยานแห่งชาติ และมีเกาะเล็กๆ 22 เกาะ เกาะที่ใหญ่ที่สุดคือOlkhon (สะกดว่า Olchon) มีความยาว 72 กม. ทะเลสาบมีแม่น้ำไหลเข้าประมาณ 300 สาย หกสายหลักคือSelenga ซึ่งเป็นแหล่งกำเนิดมลพิษของไบคาลบางส่วน ได้แก่Chikoy, Khiloh, Uda, Barguzin และUpper Angara และระบายออกทางทางออกเดียวคือแม่น้ำAngara แม้จะมีความลึกมาก แต่น้ำในทะเลสาบก็ผสมกันอย่างดีและมีออกซิเจนเพียงพอตลอดแนวน้ำ เมื่อเทียบกับการแบ่งชั้นของโครงสร้างต่างๆ เช่นทะเลสาบแทนกันยิกาและทะเลดำ แม้จะมีการประท้วงเงียบ ๆ แต่โรงงานแปรรูปเยื่อไม้ ทะเลสาบไบคาล และเซลลูโลสก็ถูกสร้างขึ้นทางตอนใต้สุดของทะเลสาบ (ที่ Baikalsk) โรงงานยังคงเทน้ำทิ้งจากอุตสาหกรรมลงในน่านน้ำของไบคาล ผลกระทบโดยรวมของมลพิษในลุ่มน้ำที่มีต่อไบคาลและแหล่งต้นน้ำที่คล้ายกันนี้ได้รับการศึกษาเป็นประจำทุกปีโดยสถาบันทาโฮ-ไบคาล ซึ่งเป็นโครงการแลกเปลี่ยนระหว่างนักวิทยาศาสตร์ของสหรัฐอเมริกา รัสเซีย และมองโกเลีย และนักศึกษาระดับบัณฑิตศึกษาของมหาวิทยาลัยที่เริ่มต้นในปี 2533 สัตว์ป่า Omul Fish ในตลาด Listvyanka ขอบเขตของความหลากหลายทางชีวภาพที่มีอยู่ในทะเลสาบไบคาลนั้นเทียบเท่ากับทะเลสาบอื่น ๆ เพียงไม่กี่แห่ง ทะเลสาบไบคาลมีพืช 1,085 สายพันธุ์และสัตว์ 1,550 สายพันธุ์ สัตว์กว่า 60% เป็นสัตว์เฉพาะถิ่น เช่น ปลา 27 จาก 52 สายพันธุ์เป็นปลาเฉพาะถิ่น แมวน้ำไบคาล ( Phoca sibirica ) สัตว์เลี้ยงลูกด้วยนมชนิดเดียวที่อาศัยอยู่ในทะเลสาบ พบได้ทั่วบริเวณทะเลสาบ แต่ไม่มีที่อื่น